L’analyse de l’ADN  de “l’homme de Denisova “enfin terminée!!!

Une découverte qui confirme une nouvelle étape : l’ADN au service des paléontologues ..

2012:L‘Institut Max Planck de Leipzig, en Allemagne, vient de  terminer la séquence du génome de l’homme de Denisova découvert en 2008.

Touristes allant vers” Denisova cave”Auteur:ЧуваевНиколай. Original uploader was ЧуваевНиколай at ru.wikipedia .CC-BY-SA-3.0, 2.5,2.0,1.0; Distribué sous la GNU Free Documentation License.

Les séquences d’ADN a montré que cet individu venait d’un groupe jusqu’alors inconnu des humains disparus qui sont devenus connus comme “Denisovans”. Ensemble, avec leur groupe frère des Néandertaliens,les” Denisovans” sont les parents les plus proches disparus de l’homme vivant actuellement.

Notons qu’en  2010, Svante Pääbo et ses collègues avaient  présenté les premiers résultats de l’étude du génome de l’homme de Denisova.

Svante Pääbo Category:Images from PLoS journalsSource: http://fr.wikipedia.org/wiki/Fichier:Plos_paabo.jpg

En 2012,  de nouvelles techniques sensibles  leur ont permis de séquencer toutes les positions dans ce génome  (environ 30 fois plus) à partir de l’ADN extrait( moins de 10 milligrammes) de l’os du doigt. (Notons qu’ en 2010, chaque position dans le génome a été déterminée, en moyenne, seulement deux fois.)

“Le génome est de très haute qualité…Nous couvrons toutes les séquences d’ADN non répétitives dans le génome de l’homme de  Denisova tant de fois qu’il a moins d’erreurs que la plupart des génomes de l’homme d’aujourd’hui qui ont été déterminées à ce jour”explique Matthias Meyer.

“Nous espérons que les biologistes pourront utiliser ce génome pour découvrir les changements génétiques qui ont été à l’origine du développement de la culture et de la technologie humaine.  C’est cela qui a permis à l’homme moderne de quitter l’Afrique et de se propager rapidement dans le monde entier, il y a 100 000 ans», explique Svante Pääbo.

L’histoire de l’Homme est en cours d’écriture ……à suivre…….

NB:Le génome est disponible à http://www.eva.mpg.de/denisova et en tant que données publiques Set via Amazon Web Services (AWS): http://aws.amazon.com/datasets/2357 .

Source:Entire genome of extinct human decoded from fossil.

Quelques rappels sur la découverte de l’homme de Denisova (2008) :article écrit en 2008

- Au cours de l’été 2008, des chercheurs découvrent, au cours de leurs fouilles, un fragment d’os dans une grotte de Sibérie, la « Denisova cave » .

Cette grotte est très connue par les paléontologues, elle renferme de nombreux outils utilisés par de l’Homme de Néandertal (Pour une période se situant entre -30000 et -40000 ans ) ; elle est située dans le nord ouest des montagnes de l’Altaï à environ 6 km du village de Chernyi Anui.

Carte de l’Altaï From de:Bild:Altai,Tienschan-Orte.png by de:Benutzer:Geof

Ce fragment de doigt est rangé pour une étude ultérieure ; il ne paraissait avoir rien de bien extraordinaire et pourtant …..

NB:L’étude de L’ADN (voir les infos en bas de l’article) apporte une aide considérable lorsque peu ou pas de structures anatomiques sont préservées .

Cet os est expédié en Allemagne à l’ Institut Max Planck( http://www.eva.mpg.de/english/index.htm) , responsable du projet du génome de Néandertal , lancé en 2006( pour séquencer les 3 milliards de bases qui constituent son génome complet ).

 Des chercheurs ont analysé son ADN mitochondrial.

 Une énorme surprise les attend :

« Cela dépasse réellement nos espoirs …. J’ai failli ne pas y croire. Cela semble trop fantastique pour être vrai ».…..dit Svante Pääbo de l’Institut Max Planck en Allemagne.

Cet ADN comporte 385 sites différents de celui de l’homme moderne …

L’ADN de l’Homme moderne présente 202 sites différents de celui de l’Homme de Néandertal …..

Et si cet ADN était celui d’une nouvelle espèce ?

Qui était cet homme de Sibérie ?

Cet os appartiendrait à une espèce qui se serait séparée de la lignée ayant conduit à l’homme moderne, il y a un million d’années environ, bien avant la séparation de “Homo sapiens” et “Homo néanderthalensis” .

Un grand merci àAlain Gallien (Professeur de SVT au lycée du Clos Maire à Beaune ) pour ce document réalisé le 5 Avril 2010: http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=2159

NB: Les chercheurs ont appelé l’Homme de Denisova “X woman” en référence à son ADN mitochondrial (transmis par la mère à ses enfants) .

 Un autre schéma de cette évolution buissonnante :http://www.hominides.com/data/images/buisson/evolution-des-hominides.png

Quelques explications : les espèces fossiles de la lignée humaine sont réparties en deux genres : Australopithecus et Homo.

-Les australopithèques ont acquis une bipédie permanente; ils ont été retrouvés en Afrique.

-Le genre Homo, très diversifié, est caractérisé par une augmentation progressive de la capacité crânienne et une régression de la face. .. les fossiles identifiés avec certitude sont tous africains.

L’homme moderne, Homo sapiens, est la seule espèce actuelle du genre Homo: Il est apparu en Afrique ou au Proche-Orient et a colonisé tous les continents.

“L’homme de Denisova” aurait quitté l’Afrique après Homo erectus et avant les ancêtres de l’Homme de Néandertal …Homo sapiens l’a quittée plus tard…

- Ci-dessous:les migrations d’Homo sapiens

Par Alain Gallien : Professeur de SVT au lycée du Clos Maire à Beaune (Côte d’Or)

Cette nouvelle espèce, “Homo “Denisova”, serait contemporaine d’Homo sapiens et d’Homo neanderthalensis ( il y a 30000 à 40000 ans en arrière). A proximité de l’os, les paléontologues ont retrouvé des parures, des outils ….on peut donc supposer qu’il était probablement aussi évolué qu’Homo sapiens et Homo neanderthalensis.

Il faudrait analyser de L’ADN nucléaire pour clairement définir les liens entre cet Homme de Sibérie, l’Homme moderne et l’Homme de Néandertal…...

NB : N’oubliez pas qu’en 2003, « Homo Floresiensis » , l’Homme de Flores, avait été découvert dans une caverne de l’île de Flores (Java, en Indonésie)…..

Sa trace n’est retrouvée qu’à cet endroit (entre 12 000 et 95 000 ans en arrière)… Voir l’article sur : http://www.hominides.com/html/ancetres/ancetres-homo-floresiensis.php

Récemment, la découverte, sur ce même lieu, d’éclats de pierre (utilisés comme des outils primitifs) laisse envisager que ses ancêtres étaient là bien avant, au moins 120.000 ans plus tôt…. (Source : http://www.nature.com/news/2010/100317/full/464335a.html)

Source partielle : http://www.nature.com/news/2010/100324/full/464472a.html

Compléments : l’ADN? De quoi s’agit-il?

Voir le document:

http://lewebpedagogique.com/arnaud/files/2009/09/a-la-recherche-du-programme-genetique10.pdf

-Chaque chromosome est constitué d’ADN.

Source: http://fr.wikipedia.org/wiki/Fichier:Chromosome_fr.svg

Sur les chromosomes, on localise de nombreuses portions : les gènes porteurs d’informations génétiques codant pour des caractères propres à l’espèce , mais aussi à chaque individu (groupe sanguin, couleur des yeux…).

-Une autre forme d’ADN existe: il ne se trouve pas dans le noyau des cellules, mais dans des organites du cytoplasme (mitochondries): c’est l’ADN mitochondrial, il est transmis par la mère.

Structure simplifiée d’une cellule

Schéma d’une mitochondrie.

Source: http://fr.wikipedia.org/wiki/Fichier:Animal_mitochondrion_diagram_fr.svg