Les antibiotiques – TP

Cliquer pour afficher l’énoncé de l’activité

Un lien figure dans l’énoncé pour télécharger les fichiers des données moléculaires à exploiter avec Geniegen ou Anagène, et Libmol

Pour prolonger cette activité et comprendre l’origine de la résistance des bactéries aux antibiotiques et les problèmes que cela soulève, consulter l’article « La résistance des bactéries : un processus de sélection naturelle »

Mac, Faire tourner les logiciels Windows sous

De nombreux logiciels SVT sont développés uniquement sous Windows. Aussi les élèves sous Mac sont-ils génés pour les utiliser chez eux. Voici quelques éléments pour s’en sortir quand même !

Essai infructueux : Wine incompatible avec Mac OS CATALINA.

Essai Wine sur MacOS SIERRA : fructueux

Téléchargement :
« Wine »

INSTALLATION :
Double cliquez sur le fichier d’installation du programme pour commencer, puis faites glisser ensemble les icônes de Wine jusqu’au dossier nommé Applications. (c’est un classique sur MAC)
LANCEMENT D’UN PROGRAMME WINDOWS
une fois Wine installé, clic-droit sur le fichier.exe du programme souhaité et choisir « ouvrir avec » Wine.app (après installation du logiciel)
Cliquez sur « Go ».
Le programme se charge s’il est supporté par Wine.
Si NON, on doit procéder à l’installation de Boot Camp (c’est ce que je faisais avant)
LOGICIELS TESTES :
Anagene 2 OK
Rastop OK
Tectoglob OK
Sismolog OK
OndesP OK
Nerf Ok
SimulAiry OK
Derive OK
Geosciences 3D (Failles transformantes) OK
Homininés ECE OK
EduAnatomist fonctionne mais lentement
Phylogène Collège et Lycée « complet » Fonctionne également parfaitement

Les mésanges

[su_document url= »https://lewebpedagogique.com/gaffezsvt/files/mesanges2019.pdf » width= »900″ height= »900″][su_document url= »http://lewebpedagogique.com/gaffezsvt/files/polydactylie.pdf » width= »900″ height= »900″][/su_document]

Téléchargement des fichiers

Poecile montanus :

Poecile palustris :

Spécimen 1 :

Spécimen 2 :

Une amylase défectueuse ?

[su_spoiler title= »Consigne » style= »fancy »]Lors de leur recherche de nouvelles variétés de blé, les chercheurs ont isolé une souche de blé qui germe mal. En l’étudiant, ils ont établi que le défaut de germination est lié à des difficultés pour le grain à mobiliser son amidon. En effet, lors de la germination, le grain de blé produit de l’amylase qui va lui permettre de dégrader les réserves amylacées. Les chercheurs pensent alors à un défaut de l’amylase chez cette variété de blé. Ils vous confient le soin d’étudier cette amylase afin de vérifier leur hypothèse.

 

[/su_spoiler]

 

 

[su_spoiler title= »Ressources » style= »fancy »]

[su_tabs active= »1″ vertical= »yes »]

[su_tab title= »Séquences nucléotidiques« ]

A ouvrir dans Anagène :

La séquence nucléotidique des gènes d’une amylase active et de l’amylase de la variété étudiée

[/su_tab]

[su_tab title= »Modèles moléculaires« ]

A ouvrir dans Rastop ou Libmol :

Le modèle moléculaire de l’amylase normale avec le substrat

Le modèle moléculaire de l’amylase de la variété étudiée avec le substrat

Appellations Rastop :

  • Amylase : chaîne A
  • Substrat : 501-506

[/su_tab]

[su_tab title= »Mesure de l’activité du variant« ]

 

 

[/su_tab]

[su_tab title= » Liste des acides aminés composant le site actif de l’amylase »]

Le site actif de l’enzyme est composé des acides aminés suivants :

58, 59, 62, 63, 104, 105, 106, 147, 151, 162, 163, 201, 233, 235, 240, 299, 300, 305, 306, 307

[/su_tab][/su_tabs]

 

 

[/su_spoiler]

Les anticorps

Activité 1

[su_document url= »https://lewebpedagogique.com/gaffezsvt/files/1SPE_anticorps_oucht_TP2021.pdf » width= »900″ height= »900″][/su_document]

 

Activité 2

[su_document url= »https://lewebpedagogique.com/gaffezsvt/files/1SPE_Ac_specific_TP2021.pdf » width= »900″ height= »900″][/su_document]

 

 

Les fichiers nécessaires :

complexe_AG_AC.pdb

fichier AC-chaines.edi

fichier 4AC-chaînes.edi

Ressources logicielles :

Anagène

(Rastop)

Libmol

Test d’Ouchterlony

La menace moustique

Depuis le 2 mars 2039, Mars est colonisé par l’Homme qui y implante des bases. Fondée le 21 juillet 2069, la base Arès XVI est dirigée par le Commandant Augustine Eywa et l’ingénieur Franck Flanders.

Le 1er septembre 2076, 30 nouveaux colons sont arrivés après un long voyage à bord du vaisseau Théia.

Quelques semaines plus tard, le commandant lance une alerte sanitaire ….

Pour remplir votre mission, le commandant a mis à votre disposition :

– une liste des caractéristiques de quelques insecticides

– un fichier Alerte-Moustiques.edi comportant les séquences du gène de l’acétylcholine-estérase et du canal sodium des deux populations de moustiques (le logiciel Anagène permet de traiter ce type de données) :

Acétylcholine-estérase :

  • population sauvage sensible : allèle AchES
  • population martienne résistante : allèle AchER

Canal Sodium :

  • population sauvage sensible : allèle Na-Terre
  • population martienne résistance : allèle Na-Mars

L’acétylcholine estérase permet une bonne transmission de l’information nerveuse aux muscles. Les canaux Sodium jouent un rôle important dans la propagation des messages nerveux.

Le commandant Eywa attend votre rapport argumenté au plus vite. Il y a urgence sanitaire !

Pour aller plus loin dans la lutte contre les moustiques : https://youtu.be/iH714n6o040