22 mai 2014:journée internationale de la biodiversité

La journée internationale de la biodiversité est organisée chaque année le 22 mai partout dans le monde.

C’est l’occasion de s’interroger sur les enjeux liés à la protection de la biodiversité et de la préservation des espèces.

[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=GuS9EU4iRjw[/youtube]

biodiversitéLe thème de la biodiversité  insulaire a été choisi pour coïncider avec la décision de l’Assemblée générale des Nations Unies de désigner 2014 comme étant l’Année internationale des petits États insulaires en développement… En savoir plus sur le site de l’ONU

  Quelques pistes pour parler de la biodiversité :

  • « Parler de la vie et de sa diversité revient à parler de tout ce qui existe sur la planète Terre…. … » voir le dossier du  CNRS
  • La biodiversité est en danger ! La  réalité du  réchauffement climatique doit modifier notre façon d’envisager le Monde et constitue donc un enjeu pédagogique majeur . Le changement climatique et la biodiversité sont des thèmes pluridisciplinaires, ils figurent dans les programmes d’enseignement du primaire,du collège et du lycée. Aujourd’hui notre Planète entre dans une nouvelle ère, elle se réchauffe.  L’Homme par ses activités est responsable de ce changement de climat. Climat et biodiversité sont étroitement liés: au fur et à mesure que le climat change, la biodiversité est érodée … voir l’article ici
  • L’acidification des océans: l’océan est un milieu très stable depuis au moins 100 millions d’années…Mais l’ Homme, par ses activités vient changer cet équilibre : en 100 ans l’océan est devenu 30% plus acide, il sera  50% plus acide à la fin de ce siècle …L’acidification des océans est un problème majeur, lié au réchauffement climatique, la biodiversité des océans est menacée …. à voir ici
  • Le changement climatique va -t-il intensifier les invasions biologiques ?

Les invasions biologiques représentent l’une des plus grandes menaces qui pèsent sur la biodiversité. L’Union internationale pour la conservation de la nature a défini « 100 espèces invasives parmi les pires à travers le monde ». Les espèces invasives sont un danger pour la biodiversité… à voir ici

  • La hausse du niveau de la  mer, causée par le réchauffement climatique, menace  à l’horizon 2100 entre 5 et 12% des îles françaises.

coraux biodiversité

5% et 12% de ces îles risquent d’être totalement submergées dans le futur. A l’échelle de la planète, ils prédisent qu’environ 300 espèces endémiques insulaires risquent fortement de disparaître, tandis que des milliers d’autres verraient leur habitat se réduire de façon dramatique: à voir ici

  • voir tous les autres articles ici
  • Sur le site du CRDP de Toulouse ici

[youtube]http://www.youtube.com/watch?v=QBQwLXgTD5U#t=30[/youtube]

Des spermatozoïdes géants datés de 17 millions d’années

Des spermatozoïdes géants de petits crustacés d’eau douce, datés de 17.000.000 années, ont été visualisés par le synchrotron ( ESRF)

Une équipe internationale de scientifiques a révélé que les spermatozoïdes  fossilisés sont les plus anciens spécimens connus de ce  genre ( en effet ils sont plus grands que les ostracodes dont ils sont issus) .

« Il s’agit des spermatozoïdes fossilisés les plus anciens jamais découverts selon les données géologiques », a annoncé mercredi le paléontologue Mike Archer, de l’université de Nouvelle-Galles du Sud.

 

De plus la reproduction de cet ostracode est la même aujourd’hui qu’ il ya des millions d’années. Les résultats sont publiés dans  journal du « Proceedings of the Royal Society B ». (14 mai 2014).

Le synchrotron  de Grenoble ?

Des précisions sur cette découverte

  • Les spermatozoïdes  fossilisés sont  issus de petits crustacés d’eau douce, les ostracodes .

ostracode JPGOstracode /@Anna33 wikipedia

  • Ils proviennent du site fossilifère de Riversleig ( région du Queensland) en Australie:

Les fossiles ont été collectés par  l’UNSW en  1988 et analysés  à « La Trobe University » où les chercheurs ont découvert qu’ils contenaient des tissus mous . Ensuite ils ont été étudiés conjointement par  l’université Ludwig Maximilian de  Munich en Allemagne et par le  Dr Paul Tafforeau à l’ ESRF.

 

batcave2 (500x340) Le site de Riversleigh /source esrf.eu
La ligne rouge indique la superficie approximative du sol de la grotte.

« La découverte de fossiles de spermatozoïdes , avec leurs noyaux , était totalement inattendue »a déclaré le professeur Mike Archer, de l’Université de Nouvelle-Galles du Sud (UNSW).

  • En tout 66 ostracodes fossiles ont été examinés.

fossil1 (500x454)un ostracode fossile source ESRF

Le noyau de chaque cellule de spermatozoïde  est observé par nanotomographie.

spermimage1 (500x500)Dans la section ci contre , les noyaux sont les points noirs à l’intérieur de chacun des cercles.

Crédit: Renate Matzke-Karasz.

On pense que les spermatozoïdes  étaient  plus longs  que tout le corps des crustacés mâles  fossilisés, mais ils étaient enroulés à l’intérieur de leurs organes sexuels .

NB:Ces spermatozoïdes mesurent quelque 1,3 millimètre, soit une taille légèrement supérieure à celle du crustacé…

Comment se sont-ils conservés ?

ll y a environ 17 millions d’années, ce site était une grotte au milieu d’une vaste forêt tropicale biologiquement diversifiée. Des minuscules ostracodes ont y prospéré dans une piscine d’eau douce .

L’eau a été  constamment enrichie en phosphore par les déjections  riches  de milliers de chauves-souris, ces conditions ont été favorables à leur conservation .

 Source partielle de l’article: ESRF

Le sapin de Cilicie en danger au Liban

Pour le grand public, le Liban est surtout connu par le Cèdre qui porte son nom. Mais aujourd’hui le sapin de Cilicie , Abies cilicica, également ancré dans l’histoire du pays est en danger

sapinsPour le sauver, une équipe internationale de chercheurs ( Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier ,  laboratoire Ecologie des forêts méditerranéennes  , Centre National de Télédétection du Liban ) a étudié la répartition et la diversité génétique de ce conifère.

Population de sapin de très faible densité (population naturelle et riche en allèles privés) ravagée par une carrière (©LaraAwad)

L’histoire du sapin de Cilicie

sapin de Cilicie_

Sapin de Cilicie source.hortipedia

Il y a plus de 4000 ans, à l’époque des pharaons, ces sapins  étaient largement exploités: les textes égyptiens antiques attestent l’utilisation du sapin de Cilicie  Abies cilicica pour son bois, au cours de l’Ancien Nouvel Empire égyptien; c’est  un signe de la puissance du Pharaon, en particulier dans la construction des temples et des navires

Pendant la Seconde Guerre mondiale, le bois de Abies cilicica a été coupé  pour construire le chemin de fer entre Tripoli et Haïfa

 

Aujourd’hui, les sapins de Cilicie représentent  1,2 % de la surface des forêts libanaises.

« Les forêts sont extrêmement fragmentées, soumises à des pressions anthropiques élevées comme la déforestation ou le pâturage intensif », explique Lara Awad, doctorante à l’ISEM.

Quelles menaces  pèsent sur le sapin de Cilicie ?

  Pour les identifier, les chercheurs ont effectué les analyses génétiques de ses populations; voici les résultats de l’étude :

  •  la diversité génétique des sapins de Cilicie est très faible. (bien plus faible que celle des autres sapins européens, comme le sapin pectiné de France, le sapin de Céphalonie de Grèce et le sapin de Bornmüller de Turquie ).

« Cette faible diversité génétique met le sapin libanais en danger face aux changements de son environnement », affirme Lara Awad.

  • Ce sapin libanais ne manque pas de ressources.
  • Il est capable de migrer en altitude lors de changements climatiques( il a ainsi  survécu à la dernière période glaciaire il y a plus de 10 000 ans)
  • Il peut aussi aider les populations marginales menacées, réduites à quelques dizaines d’arbres.

« Les sapins usent alors de moyens naturels et rares comme la dispersion de graines ou de pollens sur des distances de 15 à 20 km pour empêcher une trop forte dérive génétique », précise la chercheuse.

 

Cependant, malgré ses capacités d’adaptation, le constat pour le sapin de Cilicie est sans appel : si rien n’ai fait pour préserver sa diversité génétique, le sapin de Cilicie va disparaitre.

 Au Liban, l’UICN estime « en danger critique » le sapin de Cilicie

 Sources partielles de l’article: CNRS, PLOSONE

Un virus passeur de gènes entre insectes

Des transferts horizontaux de gènes  par un virus ont été identifiés entre deux espèces de papillons d’Amérique du nord : la fausse arpenteuse du chou et le sphinx du tabac.

Ils possèdent des gènes quasiment identiques. Ce transfert de gènes serait fait par l’intermédiaire d’un virus connu pour infecter les papillons.

Cette étude a été réalisée par une équipe de chercheurs français de l’Institut de recherche sur la biologie de l’insecte – IRBI (CNRS/Université Francois-Rabelais de Tours) et du laboratoire Ecologie et biologie des interactions – EBI (CNRS/Université de Poitiers) .

virus dans chenille du sphinx du tabacb045_250_2

Les chenilles des papillons (à gauche, la chenille du sphinx du tabac, à droite la fausse arpenteuse du chou) se sont échangés des gènes par l’intermédiaire d’un virus connu pour les infecter. (© IRBI)

La transmission verticale de l’information génétique

Elle s’effectue de parents à descendants, c’est l’un des piliers de la biologie évolutive moderne.

La transmission horizontale de gènes

De nombreuses études la décrivent. Elle se produit entre des organismes incapables de se reproduire entre eux:

  • Chez les bactéries: ce type de transfert d’un morceau de génome est  impliqué par exemple dans la résistance aux antibiotiques. Ce transfert de gènes est fréquent et son mécanisme est bien connu.
  • Chez les organismes multicellulaires, un nombre croissant de transferts horizontaux est aussi décrit, y compris entre des animaux.

Ex: chez une espèce de puceron  on a trouvé des gènes de champignon permettant de synthétiser des caroténoïdes (qui lui confèrent une belle couleur orange).

Cependant, les mécanismes et les vecteurs impliqués dans les transferts horizontaux entre animaux restent inconnus.

Comment ce transfert  horizontal de gènes chez les animaux pluricellulaires  est-il possible?

Les chercheurs ont étudié le cas de deux espèces de papillons : la fausse arpenteuse du chou et le sphinx du tabac.

Ils ont montré qu’elles possédaient en commun plusieurs copies de deux gènes quasiment identiques.

Ils ont ensuite émis  l’hypothèse qu’un virus connu pour infecter les deux espèces d’insectes, un baculovirus, pouvait avoir joué le rôle de passeur.

Comment valider cette hypothèse de transfert horizontal de gènes par ce virus  ?

Pour la valider, ils ont séquencé plus de 180 000 génomes de virus récoltés sur des chenilles infectées.

Résultat : non seulement les gènes « sauteurs » des papillons ont été identifiés dans le génome du baculovirus, mais la fréquence à laquelle on les retrouve est loin d’être anecdotique, puisqu’un virus sur 8500 les possède.

« Dans la nature, les chenilles s’infectent en ingérant des dizaines de milliers de particules virales collées sur les végétaux qu’elles consomment. La possibilité qu’elles ingèrent des gènes d’un papillon tué par le virus est donc non négligeable », commente Clément Gilbert, chercheur CNRS au laboratoire EBI et co-auteur de l’article paru dans Nature Communications.

 

virusPopulation de baculovirus observée en microscopie électronique à transmission/ source université de Poitiers

La prochaine étape sera de vérifier si les virus jouent les passeurs entre d’autres êtres multicellulaires…

Sources partielles de l’article: CNRS, Université de Poitiers